OK, so I see that the confederation existed for about two years, but the new constitution came into effect only on November 1st 1898.
I checked some Spanish sources which claim that each state remained independent. They came together only with regard to foreign policy. There seems to be very little written on that since the "Greater Republic"/"República mayor" was, in the end, so inconsequential.
Now, interestingly,
Honduras did not change their coinage in any way during that period. They kept calling themselves República de Honduras". And
El Salvador likewise. For some reason, only Nicaragua went from República to Estado.
But interestingly, the postage stamps tell another story. See
here for Nicaragua, and
there for El Salvador where "Estado" is used on stamps. Under
República de Honduras you can read this, which is taken from the
Wikipedia entry for Honduras (sorry, it's in Spanish; I added the bold, which says: The three republics converted themselves into states"):
«Algunos de los estados centroamericanos, intentaron varias veces la reconstitución de la República Federal de Centro América. Pero estas tentativas fracasaron y costaron la vida a varios de sus iniciadores. Un último intento se llevó a cabo, por influencia del Dr. Policarpo Bonilla, Presidente de Honduras, se celebró un tratado con Nicaragua y El Salvador, según el cual, las tres repúblicas constituyeron una federación bajo el nombre de República Mayor de Centro América.
Las tres repúblicas se convirtieron en estados, y la soberanía de la federación recayó en una Dieta compuesta por tres miembros, uno por cada estado, que había de reunirse cada año en la capital de los estados federales. Por invitación de esta Dieta, los tres estados nombraron una delegación que se reunió como Asamblea Constituyente en Managua, y estableció una Constitución, según cuyos términos los tres estados tomaron el nombre de Estados Unidos de la América Central, el 1º de noviembre de 1898.
Esta Constitución, que en la mente de aquellos que la habían formado significaba una consolidación de los tres estados federales y una pronta reorganización de la gran República de la América Central, soñada por Francisco Morazán, tuvo un triste fin. El día después de haberse reunido la Asamblea Constituyente, un movimiento revolucionario, hostil a la nueva federación, tuvo lugar en San Salvador, el cual dio por resultado una nueva administración en este estado. Su primer paso fue retirarse de la Unión, y esta separación ocasionó la disolución de los Estados Unidos de la América Central, pues, siguiendo el ejemplo de El Salvador, los estados de Honduras y Nicaragua reasumieron su soberanía.»
So, it looks like, indeed, the use of "Estado" by Nicaragua is linked to the formation of the Greater Republic, but there was no-one with a gun at your head to tell you to change the name on your coinage.
₱o$₮ag€ $₮am₱$ a₹€ mo₹€ £€₲i₮ima₮€ a$ a ƒo₹m oƒ ¢u₹₹€nc¥ ₮ha₦ ₮h€ €₦₮i₹€ "¢oi₦" ₱₹odu¢₮io₦ oƒ ₦au₹u o₹ ₦iu€. ••• £€$ ₮im฿₹€$-₱o$₮€ $o₦₮ ₱£u$ £é₲i₮im€$ €₦ ₮a₦t qu'o฿j€₮$ mo₦é₮ai₹€$ qu€ £a ₱₹odu¢₮io₦ €₦₮iè₹€ d€ «mo₦₦ai€$» d€ ₦au₹u ou d€ ₦iu€.